高性能计算在重大科学发现的前沿基础科学研究领域已逐渐成为不可或缺的重要手段之一。从分子动力学模拟、生物制药、材料电子结构计算、材料模拟到 HPC 数据可视化，都离不开高性能计算的支持。

高性能计算和科学计算的过程往往伴随着庞大的数据量以及高计算力需求，同时需要借助专门的应用软件来提升效率。比如面向分子动力学的计算软件 LAMMPS、模拟软件 GROMACS，面向材料电子结构计算的 VASP，以及冷冻电镜三维图像数据处理软件 RELION，面向电子结构计算和纳米尺度材料建模的开源软件包 Quantum Espresso 以及 HPC 数据可视化工具 ParaView & IndeX 等 HPC 经典应用软件，能够帮助科学家大幅提升工作效率，加速科学发现。

这类应用软件都属于计算密集型应用，具有计算量大、通讯密集、I/O 要求高等特点，通常需要跨多个计算节点利用 GPU 并行处理能力，来保证其高效、可靠、快速地运行。

5月起，智东西公开课与 NVIDIA 共同策划推出「GPU 加速高性能计算（HPC）经典应用在线研讨会」，计划开设两场。研讨会聚焦经典高性能计算和科学计算应用，以及如何在 GPU 平台更好的加速这些应用。

5月26日，「GPU 加速高性能计算（HPC）经典应用在线研讨会」第一场已顺利完结。第一场由NVIDIA（英伟达）高级系统架构师易成、解决方案架构师戴志翔和解决方案架构师马四腾三位技术专家主讲，重点探讨了应用于分子动力学和材料电子结构计算的三大软件：LAMMPS、GROMACS 和 VASP。错过直播的朋友可以点击文章底部「阅读原文」收看完整回放。

6月22日，「GPU 加速高性能计算（HPC）经典应用在线研讨会」第二场将开讲。此次研讨会将重点探讨冷冻电镜三维图像数据处理软件 RELION、电子结构计算和纳米尺度材料建模的开源计算软件包 Quantum Espresso 和 HPC 数据可视化工具 ParaView & IndeX 在 GPU 上的安装、部署和优化加速方法。

NVIDIA 解决方案架构师石道辰、解决方案架构师况吕林、解决方案架构师匡磊三位技术专家，将分别以《使用 GPU 加速 RELION 生物结构解析》、《GPU 加速 Quantum Espresso 进展及应用》、《GPU 加速 ParaView & IndeX 数据可视化》为主题进行直播讲解。

研讨会将在智东西公开课知识店铺以视频直播形式进行，从下午13:30开始，持续到16:15。其中，16:00-16:15为问答环节，三位主讲人将在线答疑。

主题介绍

1、石道辰，NVIDIA 解决方案架构师：《使用 GPU 加速 RELION 生物结构解析》

冷冻电子显微镜是获取生物结构的一种重要手段，大量的数据需要经过特定的算法来进行处理。RELION 实现了基于贝叶斯的算法，并可以利用 GPU 进行加速计算。本次讨论会将介绍 RELION 的编译安装与运行，并以典型例子为基础，结合计算任务的资源使用情况，介绍合理的 CPU/GPU 任务分配方式，从而加速生物结构解析。

2、况吕林，NVIDIA 解决方案架构师：《GPU 加速Quantum Espresso 进展及应用》

Quantum Espresso 是广泛用于电子结构计算和纳米尺度材料建模的开源计算软件包，它主要基于密度泛函理论、平面波和赝势方法。本次研讨会将介绍 Quantum Espresso 最新版本在 GPU 上的支持情况，以及如何更好地在 GPU 上使用 Quantum Espresso，包括使用容器、基于源码编译安装，以及运行最佳实践等。

3、匡磊，NVIDIA 解决方案架构师：《GPU 加速 ParaView & IndeX 数据可视化》

快速可视化模拟结果对于科学发现至关重要。但是，现有的可视化工具无法提供大型结构化和非结构化数据集的实时体验。NVIDIA IndeX™ 是领先的 HPC 数据可视化工具，有助于应对这一挑战。IndeX 利用 GPU 的计算能力，通过在 GPU 加速的集群中分布可视化工作负载，来提供大型数据集的实时可视化性能。

现在，IndeX 已集成到 ParaView — HPC 中最流行的可视化工具之一。这意味着用户可以使用最新版本的 ParaView 默认访问 IndeX 功能，并体验到与现有数据可视化的实时交互性。

本次研讨会将重点阐述 ParaView 及 IndeX 的安装和使用方法，并对 GPU 的支持情况、算力需求及扩展性进行讲解。

报名方式

对研讨会感兴趣的朋友，可以扫描下方二维码，添加小助手瑞秋进行报名。已添加过瑞秋的老朋友，可以给瑞秋私信，发送“英伟达2205”即可报名。

同时，为了方便大家交流和咨询，针对「GPU 加速高性能计算（HPC）经典应用在线研讨会」还设置了专属交流群，将会邀请主讲人加入。希望加入交流群与主讲人直接认识和交流的朋友，也可以向瑞秋进行申请。